Охрана растений - часть комплексной системы мероприятий, направленных на рациональное (не приводящее к истощению) использование и воспроизводство природных ресурсов, в том числе на сбережение видового многообразия. Осуществление этих мероприятий невозможно без охраны основных растительных сообществ.

Заповедный фонд республики включает часть Кавказского государственного биосферного заповедника, Шовгеновский, Даховский заказники. В июле 1992 г. в  Адыгее вновь созданы два ботанических заказника. Их базой стали лесохозяйства "Майкопское" и  "Кужорское". Даже на территории километровой охранной зоны, которая организована  вокруг заказников, запрещен сбор цветов, ягод, грибов, дикорастущих плодов.

В январе 1990 г. в состав заповедника возвращен Фишт-Оштеновский массив, находящийся на стыке двух геоботанических подпровинций - Колхидской и Кубанской. На этой небольшой части Северо-Западного Кавказа нашли приют более 120 видов растений, которые нигде более, кроме как на Кавказе не встречаются. Некоторые из этих растений растут только здесь. Так, например, ареал произрастания колокольчика Отрана ограничен подножием г. Фишт.

В августе 1992 г. решением правительства Республики Адыгея высокогорное плато Лагонаки также возвращено в состав Кавказского заповедника.  Огромную площадь высокогорной части нагорья занимают низкотравные и среднетравные луга, альпийские лишайниковые, пустоши. Северная часть склона покрыта лесами из пихты, бука, березы, сосны. Здесь сконцентрированы эндемичные виды, всего 124 из 405, кавказского и колхидского происхождения. Встречаются участки сообществ самшита колхидского, тиса ягодного, каштана благородного. Все эти растения, редкие растительные сообщества, вновь находятся под надежной защитой заповедника.

На территории республики следует вести работу по исследованию, охране, рациональному использованию растительных ресурсов. С этой целью на агробиологической станции Адыгейского госуниверситета создан коллекционный участок редких и лекарственных растений местной флоры, заложен дендроучасток. Такую работу необходимо проводить в каждой школе.

Проведение лесовосстановительных работ на вырубках, сохранение всех насаждений, обладающих средообразующими свойствами и расположенных в охранных зонах, комплексное  использование и охрана природных ресурсов, создание коллекционных участков и питомников редких и полезных для человека растений позволят сохранить неповторимую флору и растительность.

Кабинет Министров Республики Адыгея принял в мае 1996 года постановление: "Об утверждении Программы сохранения и использования генетического фонда "старых черкесских садов", дикоплодовых деревьев и кустарников на территории РА". Программа предусматривает:

• выбор и сохранение оставшихся сортов плодовых деревьев и кустарников в "старых черкесских садах" (1997-2000 гг.);
• выделение лучших форм и создание постоянных лесосеменных участков дикоплодовых (1997-2004 гг.);
• массовое размножение и разведение лучших форм, сортов дикоплодовых (1999 и все последующие годы).

Каждый может и должен внести свой вклад в изучение и сохранение уникальной природы Республики Адыгея.